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餌料微藻指需要借助顯微鏡才能觀察到的一類可以被海水動物幼體攝食，并能滿足它們營養需要的微型藻類的統稱。目前世界上在海水人工養殖業中常用的餌料微藻約有20多種。我國在海水動物人工育苗中常用的餌料微藻主要有：硅藻類的牟氏角刺藻（Cheatoceros muelleri），三角褐指藻（Phaeodactylum trecornutum）、中肋骨條藻（Skeletonema costatum）、底棲舟形藻（Navicula sp.）、底棲卵形藻（Cocconeis sp.）；金藻類的綠光等鞭藻（Isochrysis galbana）及其3011品系和8701品系；綠藻類的亞心形四片藻（Tetraselmis subcordiformis）、海水小球藻（Chlorella sp.）和藍藻類的鈍頂螺旋藻（Spirulina platensis），以及裸藻類的纖細裸藻（Euglena gracilis）等。如下表。其實在大規模的海水養殖育苗生產中，各育苗場根據自己的實際情況，選擇其中的2—3種藻類進行培養培育，就能滿滿足整個育苗過程的需要。